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疾病
Ct值計算及臨床意義的討論
COVID-19於2019年底出現並席捲全球。截至今年5月底,台灣累計確診病例已達2,032,983例,單日確診病例已攀升至8萬多例。與此同時,“PCR”、“Ct值”等術語也頻繁出現在我們的生活中。我們將從PCR原理開始,介紹Ct值的含義,並解釋Ct值與病毒載量之間的關係,以及這些術語可能被混淆和誤用的常見情況。

即時熒光定量PCR原理簡介
與傳統的反轉錄即時聚合酶鏈鎖反應(RT-PCR)相比,即時聚合酶連鎖反應(也稱為Real-Time PCR,以下簡稱“qPCR”)是基於PCR擴增的原理來擴增cDNA模板。不同的是,即時聚合酶連鎖反應使用特定的引物和探針在反應過程中產生熒光信號,通過熒光檢測技術設備獲得即時定量結果。反應完成後可以立即顯示測試結果。

qPCR中常用的校準熒光團可分為非特異性(SYBR Green)和特異性(TaqMan探針)。臨床檢測主要基於TaqMan探針。TaqMan 探針是一種合成寡核苷酸,兩端標記有不同的熒光物質。5'端的熒光是報告基團(R),3'端的熒光是猝滅基團(Q)。當探針處於游離狀態時,報告基團和猝滅基團之間的相互作用掩蓋了彼此的熒光信號。當探針隨著cDNA複製而被水解時,報告基團與猝滅劑分離,猝滅基團失去掩蔽報告基團的作用,從而可以檢測到報告基團的熒光信號(圖1)。
Figure 1: Schematic diagram of TaqMan action
圖1:TaqMan動作示意圖
Ct值計算及含義
由於 DNA 構成半保留複製,因此目標模板的反應被放大至 2 的 N 次方。病毒的每一次復制構成一個週期; “Ct值”是循環閾值的縮寫。當進行 qPCR 反應時,患者樣本中的目標核酸模板繼續以 2 的 2 次方的速率擴增(圖 2)。同時,用特異的TaqMan探針檢測病毒的特異基因片段。當核酸擴增超過設定的閾值/截止值時,可以進行檢測。此時的Ct值代表病毒已復制的次數。例如,當 Ct 值為 25 時,這意味著它已經經歷了 25 個循環,進而表明病毒在檢測之前已擴增了 2 的 25 次方。因此,當某天患者體內的病毒量較高時,需要進行的複制次數較少,Ct值也較低,反之亦然。
Figure 2: Ct value calculation diagram (Ct = n; RFU = 2n)
圖2:Ct值計算圖(Ct=n;RFU=2n)
通常,qPCR 反應運行 40-45 個循環,但 Ct 值需要多少週期才能被視為陽性? 它取決於試劑的檢測限 (LoD) 和閾值/截止值。

GB SARS-CoV-2 Real-Time RT-PCR kit(4PCO052E)的Ct閾值為37,檢測限(LoD)為1,000 copies/ml,代表患者體內病毒載量極低。該病毒需要擴增 2 的 37 次方(Ct = n,病毒拷貝數 = 2n)才能使用 GB SARS-CoV-2 反轉錄即時聚合酶鏈鎖反應試劑盒進行檢測。通過了解Ct值背後的原理,我們可以獲得更多信息,比如推測與疾病的嚴重程度、死亡率、傳染性等。大多數人可能直觀地認為患者的Ct值越低,病毒載量就越高; 而且症狀的嚴重程度和傳染性也相對較高。但實際上,這種現像在臨床上並不是絕對的。這是因為Ct值並不是一個絕對值,它會受到採樣方法、樣本類型、試劑質量、採樣時間等多種因素的影響。

Ct值當然是一個重要的依據; 在當前的 COVID-19 醫療決策中。但Ct值只是確診患者陽性時參考的指標之一。醫生仍會使用患者的症狀作為決策的主要依據。

除了參考試劑本身的檢測限外,隨著每日確診病例數的上升,世界各國政府也在放寬Ct值檢疫標準。與解除隔離相關的Ct值越高,則越嚴格;這種做法比較適合確診病例數量較少、需要防止病毒傳播的情況。但當感染人數過多、醫療資源消耗過多時,就必須考慮為重症患者保留足夠的醫療資源,平衡防疫及經濟活動。
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